يَدرُسُ كتابُ مُحمَّد النَّفس الزكيَّة وكتابه في السِّيَر ثلاثَ مسائلَ رئيسة في التاريخ الثقافيَّ السياسيَّ الإسلاميَّ الأوَّلِ: ظُهور النوع التأليفيَّ الفقهيَّ المعروف بالسَّيَر في قضايا الحَرب والسِّلم، وظُهور التأليف في المعارضينَ السياسيَّينَ (البُغاة) وأحكام التعاملِ معهم؛ وتَغَيُّر النَّظَرِ إلى فلسفةِ الحُكمِ وشرعيَّتِهِ من الشُّورى والعَدلِ إلى حَقَّ القَرابةِ.